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套件:openbabel(3.1.1+dfsg-11 以及其他的)

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相似套件:

Chemical toolbox utilities (cli)

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows one to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include:

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities:

 * obabel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obgen: Generate 3D coordinates for a molecule
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obconformer: Generate low-energy conformers
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode
 * obprobe: Create electrostatic probe grid

標籤: 領域: 化學, 實做語言: C++, 使用者介面: interface::commandline, role::program, 範圍: 實用程式, Purpose: 資料轉換

其他與 openbabel 有關的套件

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下載可用於所有硬體架構的
硬體架構 版本 套件大小 安裝後大小 檔案
alpha (非官方移植版) 3.1.1+dfsg-9+b4 125。5 kB1,453。0 kB [檔案列表]
amd64 3.1.1+dfsg-11+b1 125。6 kB628。0 kB [檔案列表]
arm64 3.1.1+dfsg-11+b1 117。3 kB1,389。0 kB [檔案列表]
armel 3.1.1+dfsg-11+b1 118。7 kB502。0 kB [檔案列表]
armhf 3.1.1+dfsg-11+b1 119。0 kB466。0 kB [檔案列表]
hppa (非官方移植版) 3.1.1+dfsg-11+b1 129。1 kB561。0 kB [檔案列表]
i386 3.1.1+dfsg-11+b1 128。1 kB613。0 kB [檔案列表]
ia64 (非官方移植版) 3.1.1+dfsg-9 136。3 kB731。0 kB [檔案列表]
m68k (非官方移植版) 3.1.1+dfsg-9+b1 131。6 kB573。0 kB [檔案列表]
mips64el 3.1.1+dfsg-11+b1 122。1 kB1,408。0 kB [檔案列表]
ppc64 (非官方移植版) 3.1.1+dfsg-11+b1 123。3 kB1,471。0 kB [檔案列表]
ppc64el 3.1.1+dfsg-11+b1 124。3 kB1,453。0 kB [檔案列表]
riscv64 3.1.1+dfsg-11+b1 122。7 kB509。0 kB [檔案列表]
s390x 3.1.1+dfsg-11+b1 123。2 kB556。0 kB [檔案列表]
sh4 (非官方移植版) 3.1.1+dfsg-11 141。5 kB1,368。0 kB [檔案列表]
sparc64 (非官方移植版) 3.1.1+dfsg-11+b1 120。5 kB19,659。0 kB [檔案列表]
x32 (非官方移植版) 3.1.1+dfsg-9+b1 122。7 kB590。0 kB [檔案列表]