Пакет: sibelia (3.0.7+dfsg-3 и другие)

[ Источник: sibelia  ]

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Другие пакеты, относящиеся к sibelia

• dep: lagan

  highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, riscv64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [не arm64, riscv64]

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

Загрузка sibelia

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3.0.7+dfsg-3	309,7 Кб	1 176,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.0.7+dfsg-3+b1	292,3 Кб	1 229,0 Кб	[список файлов]
armel	3.0.7+dfsg-3	283,4 Кб	1 139,0 Кб	[список файлов]
armhf	3.0.7+dfsg-3	289,5 Кб	955,0 Кб	[список файлов]
i386	3.0.7+dfsg-3	312,3 Кб	1 151,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3.0.7+dfsg-3	278,1 Кб	1 250,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3.0.7+dfsg-3	305,1 Кб	1 228,0 Кб	[список файлов]
riscv64	3.0.7+dfsg-3+b1	302,4 Кб	1 069,0 Кб	[список файлов]
s390x	3.0.7+dfsg-3	275,7 Кб	1 128,0 Кб	[список файлов]