Пакет: covtobed (1.3.5+dfsg-2 и другие)

[ Источник: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Другие пакеты, относящиеся к covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: zlib1g

  библиотека сжатия

Загрузка covtobed

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.3.5+dfsg-2	45,8 Кб	211,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.3.5+dfsg-2	49,8 Кб	146,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.3.5+dfsg-2+b1	45,0 Кб	147,0 Кб	[список файлов]
armel	1.3.5+dfsg-2	42,8 Кб	125,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.3.5+dfsg-2	44,6 Кб	97,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.3.5+dfsg-2	45,5 Кб	123,0 Кб	[список файлов]
i386	1.3.5+dfsg-2	53,4 Кб	149,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.3.5+dfsg-2	57,1 Кб	240,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.3.5+dfsg-2	47,0 Кб	137,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.3.5+dfsg-2	46,4 Кб	215,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.3.5+dfsg-2	49,7 Кб	210,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.3.5+dfsg-2	49,7 Кб	210,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.3.5+dfsg-2+b1	48,2 Кб	111,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.3.5+dfsg-2	46,3 Кб	138,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.3.5+dfsg-2	54,0 Кб	145,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.3.5+dfsg-2	39,5 Кб	1 045,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.3.5+dfsg-2	50,4 Кб	133,0 Кб	[список файлов]