Pacote: r-bioc-rsamtools (2.22.0+dfsg-2 e outros)

[ Fonte: r-bioc-rsamtools  ]

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and 'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map), binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix) files.

Outros pacotes relacionados a r-bioc-rsamtools

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  bib. de alta qualid. de compactação de arqs. bas. em ordenação de blocos - exec

• dep: libc6 (>= 2.15) [m68k, sparc64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, m68k, sh4, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl4 (>= 7.18.0) [hppa, ia64, sh4, x32]

  biblioteca de transferência de URL do lado cliente de fácil uso (versão com OpenSSL)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0) [não hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

  biblioteca de transferência de URL do lado cliente de fácil uso (versão com OpenSSL)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

  Pacote não disponível

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Pacote não disponível

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [m68k, sparc64]

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614) [não hppa, m68k, sh4, sparc64, x32]

  biblioteca de compressão para formato XZ

• dep: libstdc++6 (>= 11) [não m68k, sparc64]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: r-api-3.4 [m68k]

  Pacote não disponível

• dep: r-api-3.5 [sparc64]

  Pacote não disponível

• dep: r-api-4.0 [não m68k, sparc64]

  pacote virtual fornecido por r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Pacote não disponível

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  Pacote não disponível

• dep: r-api-bioc-3.20 [não hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

  pacote virtual fornecido por r-bioc-biocgenerics

• dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

  Pacote não disponível

• dep: r-base-core (>= 3.4.2-2) [m68k]

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  dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

  dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.1.3) [m68k]

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  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1) [não m68k]

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• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.37.1) [m68k]

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  dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [não m68k]

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• sug: r-bioc-genomicfeatures

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• sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10) [não sparc64]

  GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data

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• sug: r-cran-runit [não sparc64]

  GNU R package providing unit testing framework

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	2.22.0+dfsg-2	3,510.1 kB	5,837.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	2.22.0+dfsg-2	3,515.3 kB	5,655.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.22.0+dfsg-2	3,481.7 kB	5,644.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	2.18.0+dfsg-1	3,506.9 kB	5,731.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	2.18.0+dfsg-1+b1	3,636.0 kB	6,843.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	2.22.0+dfsg-2	3,509.6 kB	5,771.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.30.0-1	3,206.0 kB	5,170.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	2.22.0+dfsg-2	3,470.0 kB	5,831.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	2.22.0+dfsg-2	3,554.0 kB	6,231.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	2.22.0+dfsg-2	3,563.7 kB	6,092.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	2.22.0+dfsg-2	3,526.6 kB	5,435.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	2.22.0+dfsg-2	3,528.5 kB	5,795.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	2.18.0+dfsg-1	3,552.9 kB	5,453.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.34.1-1	3,424.1 kB	5,736.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	2.14.0-1	3,666.4 kB	5,700.0 kB	[lista de arquivos]