Pacote: r-bioc-deseq2 (1.46.0+dfsg-2 e outros)

[ Fonte: r-bioc-deseq2  ]

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

Differential gene expression analysis based on the negative binomial distribution. Estimate variance-mean dependence in count data from high-throughput sequencing assays and test for differential expression based on a model using the negative binomial distribution.

Outros pacotes relacionados a r-bioc-deseq2

• dep: libblas3

  Implementações de Referências Básicas de Álgebra Linear , Biblioteca compartilhada

  ou libblas.so.3

  pacote virtual fornecido por libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [não alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não hppa, ia64, sh4]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: liblapack3

  Biblioteca de rotinas de álgebra linear 3 - versão compartilhada

  ou liblapack.so.3

  pacote virtual fornecido por libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, sh4]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [não hppa, ia64, sh4, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

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• dep: r-api-4.0

  pacote virtual fornecido por r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Pacote não disponível

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  Pacote não disponível

• dep: r-api-bioc-3.20 [não hppa, ia64, sh4, x32]

  pacote virtual fornecido por r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2) [x32]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.7.5)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-geneplotter [x32]

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• dep: r-bioc-iranges

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• dep: r-bioc-matrixgenerics [não x32]

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.1.6)

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• dep: r-cran-ggplot2 [x32]

  implementation of the Grammar of Graphics

  dep: r-cran-ggplot2 (>= 3.4.0) [não x32]

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• sug: r-cran-readr

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  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Download de r-bioc-deseq2

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.46.0+dfsg-2	1,247.8 kB	1,756.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.46.0+dfsg-2	1,256.6 kB	1,749.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.46.0+dfsg-2	1,242.7 kB	1,757.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.42.1+dfsg-1	1,234.4 kB	1,718.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.42.1+dfsg-1	1,254.7 kB	1,916.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.46.0+dfsg-2	1,247.0 kB	1,755.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.46.0+dfsg-2	1,246.0 kB	1,765.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.46.0+dfsg-2	1,257.1 kB	1,825.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.46.0+dfsg-2	1,256.0 kB	1,821.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.46.0+dfsg-2	1,253.6 kB	1,692.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.46.0+dfsg-2	1,257.6 kB	1,757.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.42.1+dfsg-1	1,256.3 kB	1,738.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.46.0+dfsg-2	1,239.5 kB	2,531.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.38.3+dfsg-1	1,258.9 kB	1,736.0 kB	[lista de arquivos]