Pacote: sra-toolkit (2.9.3+dfsg-1 e outros)
Links para sra-toolkit
Recursos de Debian:
- Relatórios de bug
- Informação de desenvolvedor(a)
- Debian Changelog
- Arquivo de copyright
- Rastreador de patch Debian
Baixe o pacote-fonte sra-sdk:
Mantenedores(as):
- Debian Med Packaging Team (QA Página, E-mail Arquivo)
- Charles Plessy (QA Página)
- Andreas Tille (QA Página)
Fontes externas:
- Pagina principal [github.com]
Pacotes similares:
utilities for the NCBI Sequence Read Archive
Tools for reading the SRA archive, generally by converting individual runs into some commonly used format such as fastq.
The textual dumpers "sra-dump" and "vdb-dump" are provided in this release as an aid in visual inspection. It is likely that their actual output formatting will be changed in the near future to a stricter, more formalized representation[s]. PLEASE DO NOT RELY UPON THE OUTPUT FORMAT SEEN IN THIS RELEASE.
The "help" information will be improved in near future releases, and the tool options will become standardized across the set. More documentation will also be provided documentation on the NCBI web site.
Tool options may change in the next release. Version 1 tool options will remain supported wherever possible in order to preserve operation of any existing scripts.
Outros pacotes relacionados a sra-toolkit
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- bib. de alta qualid. de compactação de arqs. bas. em ordenação de blocos - exec
-
- dep: libc6 (>= 2.14)
- GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb
-
- dep: libfuse2 (>= 2.6)
- Sistema de arquivos em espaço de usuário (biblioteca)
-
- dep: libhdf5-103
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - runtime files - serial version
-
- dep: libkdf5-2
- hdf5 access to data in the INSDC Sequence Read Archives
-
- dep: libmagic1 (>= 5.12)
- Reconhece o tipo de dado de um arquivo usando números "mákgicos" - biblioteca
-
- dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
-
- dep: libmbedtls12 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
-
- dep: libmbedx509-0 (>= 2.0)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library
-
- dep: libncbi-vdb2
- libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives
-
- dep: libncbi-wvdb2
- virtual layer update modul of ncbi-vdb library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Biblioteca C++ padrão da GNU v3
-
- dep: libsz2
- Adaptive Entropy Coding library - SZIP
-
- dep: libxml2 (>= 2.6.27)
- biblioteca XML GNOME
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)
- biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)
-
- rec: med-config (>= 2.1)
- Debian Med general config package
Download de sra-toolkit
Arquitetura | Versão | Tamanho do pacote | Tamanho instalado | Arquivos |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.9.3+dfsg-1+b1 | 4,816.5 kB | 9,306.0 kB | [lista de arquivos] |