Pakiet: sra-toolkit (2.9.3+dfsg-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: sra-sdk  ]

Narzędzia do Sequence Read Archive z NCBI

Narzędzia do odczytywania archiwum SRA, zazwyczaj poprzez konwersję poszczególnych przebiegów do niektórych powszechnie używanych formatów, takich jak fastq.

Narzędzia do tekstowych zrzutów: sra-dump i vdb-dump zostały zamieszczone w tym wydaniu jako pomoc w kontroli wizualnej. Jest prawdopodobne, że efektywne formatowanie ich danych wyjściowych zostanie zmienione w najbliższej przyszłości do bardziej restrykcyjnych i sformalizowanych reprezentacji. PROSIMY NIE POLEGAĆ NA FORMACIE WYJŚCIOWYM POSTRZEGANYM W TYM WYDANIU.

Informacje związane z opcją "help" zostaną ulepszone w wydaniach, które pojawią się w niedalekiej przyszłości, a opcje narzędzi zostaną znormalizowane w całym zestawie. Dodatkowa dokumentacja znajduje się również na stronie NCBI.

Opcje narzędzi mogą ulec zmianie w następnym wydaniu. W miarę możliwości opcje narzędzi z 1 wydania będą nadal obsługiwane, aby zachować możliwość funkcjonowania istniejących skryptów.

Inne pakiety związane z sra-toolkit

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.14)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libfuse2 (>= 2.6)

  System plików w przestrzeni użytkownika (biblioteka)

• dep: libhdf5-103

  Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - pliki uruchomieniowe - wydanie szeregowe

• dep: libkdf5-2

  hdf5 access to data in the INSDC Sequence Read Archives

• dep: libmagic1 (>= 5.12)

  Rozpoznawanie typu danych w pliku za pomocą "magicznych" liczb - biblioteka

• dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls12 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-0 (>= 2.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libncbi-vdb2

  libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives

• dep: libncbi-wvdb2

  virtual layer update modul of ncbi-vdb library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libsz2

  Adaptive Entropy Coding library - SZIP

• dep: libxml2 (>= 2.6.27)

  Biblioteka GNOME XML

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• rec: med-config (>= 2.1)

  Debian Med general config package

Pobieranie sra-toolkit

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.9.3+dfsg-1+b1	4 816,5 KiB	9 306,0 KiB	[lista plików]