Balík: sra-toolkit (2.9.3+dfsg-1 a iné)
Odkazy pre sra-toolkit
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík sra-sdk:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Charles Plessy (Stránka QA)
- Andreas Tille (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
utilities for the NCBI Sequence Read Archive
Tools for reading the SRA archive, generally by converting individual runs into some commonly used format such as fastq.
The textual dumpers "sra-dump" and "vdb-dump" are provided in this release as an aid in visual inspection. It is likely that their actual output formatting will be changed in the near future to a stricter, more formalized representation[s]. PLEASE DO NOT RELY UPON THE OUTPUT FORMAT SEEN IN THIS RELEASE.
The "help" information will be improved in near future releases, and the tool options will become standardized across the set. More documentation will also be provided documentation on the NCBI web site.
Tool options may change in the next release. Version 1 tool options will remain supported wherever possible in order to preserve operation of any existing scripts.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom sra-toolkit
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica
-
- dep: libc6 (>= 2.14)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libfuse2 (>= 2.6)
- súborový systém v používateľskom priestore - knižnica
-
- dep: libhdf5-103
- HDF5 (Hierarchical Data Format 5) - dynamické súbory - sériová verzia
-
- dep: libkdf5-2
- hdf5 access to data in the INSDC Sequence Read Archives
-
- dep: libmagic1 (>= 5.12)
- určenie typu dát v súbore pomocou „magických čísel” - knižnica
-
- dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
-
- dep: libmbedtls12 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
-
- dep: libmbedx509-0 (>= 2.0)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library
-
- dep: libncbi-vdb2
- libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives
-
- dep: libncbi-wvdb2
- virtual layer update modul of ncbi-vdb library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: libsz2
- knižnica Adaptive Entropy Coding - SZIP
-
- dep: libxml2 (>= 2.6.27)
- knižnica GNOME XML
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
-
- rec: med-config (>= 2.1)
- Debian Med general config package
Stiahnuť sra-toolkit
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.9.3+dfsg-1+b1 | 4,816.5 kB | 9,306.0 kB | [zoznam súborov] |