Pakiet: nast-ier (20101212+dfsg1-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Inne pakiety związane z nast-ier

• dep: cdbfasta

  Narzędzia do indeksowania i przeszukiwania CDB z plików multi-Fasta

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, m68k, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Pobieranie nast-ier

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	20101212+dfsg1-6	20,1 KiB	147,0 KiB	[lista plików]
amd64	20101212+dfsg1-6	19,9 KiB	99,0 KiB	[lista plików]
arm64	20101212+dfsg1-6+b1	20,0 KiB	148,0 KiB	[lista plików]
armel	20101212+dfsg1-6	19,2 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
armhf	20101212+dfsg1-6	19,0 KiB	90,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	20101212+dfsg1-6	19,8 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
i386	20101212+dfsg1-6	20,0 KiB	98,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	20101212+dfsg1-6	21,4 KiB	100,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	20101212+dfsg1-3	19,8 KiB	99,0 KiB	[lista plików]
mips64el	20101212+dfsg1-6	20,3 KiB	148,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	20101212+dfsg1-6	20,8 KiB	147,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	20101212+dfsg1-6	20,7 KiB	147,0 KiB	[lista plików]
riscv64	20101212+dfsg1-6	19,8 KiB	95,0 KiB	[lista plików]
s390x	20101212+dfsg1-6	20,2 KiB	98,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	20101212+dfsg1-6	19,7 KiB	146,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	20101212+dfsg1-6	19,5 KiB	1 107,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	20101212+dfsg1-6	19,6 KiB	98,0 KiB	[lista plików]