Paketti: nast-ier (20101212+dfsg1-6 ja muut)

[ Source: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Muut pakettiin nast-ier liittyvät paketit

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, m68k, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Imuroi nast-ier

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	20101212+dfsg1-6	20.1 kt	147.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	20101212+dfsg1-6	19.9 kt	99.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	20101212+dfsg1-6+b1	20.0 kt	148.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	20101212+dfsg1-6	19.2 kt	94.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	20101212+dfsg1-6	19.0 kt	90.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	20101212+dfsg1-6	19.8 kt	94.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	20101212+dfsg1-6	20.0 kt	98.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	20101212+dfsg1-6	21.4 kt	100.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	20101212+dfsg1-3	19.8 kt	99.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	20101212+dfsg1-6	20.3 kt	148.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	20101212+dfsg1-6	20.8 kt	147.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	20101212+dfsg1-6	20.7 kt	147.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	20101212+dfsg1-6	19.8 kt	95.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	20101212+dfsg1-6	20.2 kt	98.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	20101212+dfsg1-6	19.7 kt	146.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	20101212+dfsg1-6	19.5 kt	1,107.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	20101212+dfsg1-6	19.6 kt	98.0 kt	[tiedostoluettelo]