Пакет: nast-ier (20101212+dfsg1-6 и други)

[ Източник: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Други пакети, свързани с nast-ier

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, m68k, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Изтегляне на nast-ier

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	20101212+dfsg1-6	20,1 кБ	147,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	20101212+dfsg1-6	19,9 кБ	99,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	20101212+dfsg1-6+b1	20,0 кБ	148,0 кБ	[списък на файловете]
armel	20101212+dfsg1-6	19,2 кБ	94,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	20101212+dfsg1-6	19,0 кБ	90,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	20101212+dfsg1-6	19,8 кБ	94,0 кБ	[списък на файловете]
i386	20101212+dfsg1-6	20,0 кБ	98,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	20101212+dfsg1-6	21,4 кБ	100,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	20101212+dfsg1-3	19,8 кБ	99,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	20101212+dfsg1-6	20,3 кБ	148,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	20101212+dfsg1-6	20,8 кБ	147,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	20101212+dfsg1-6	20,7 кБ	147,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	20101212+dfsg1-6	19,8 кБ	95,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	20101212+dfsg1-6	20,2 кБ	98,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	20101212+dfsg1-6	19,7 кБ	146,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	20101212+dfsg1-6	19,5 кБ	1 107,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	20101212+dfsg1-6	19,6 кБ	98,0 кБ	[списък на файловете]