Paquet : nast-ier (20101212+dfsg1-6 et autres)

[ Paquet source : microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Autres paquets associés à nast-ier

• dep: cdbfasta

  indexation avec Constant DataBase et outils de recherche pour les fichiers multi-FASTA

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, m68k, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

Télécharger nast-ier

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	20101212+dfsg1-6	20,1 ko	147,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	20101212+dfsg1-6	19,9 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	20101212+dfsg1-6+b1	20,0 ko	148,0 ko	[liste des fichiers]
armel	20101212+dfsg1-6	19,2 ko	94,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	20101212+dfsg1-6	19,0 ko	90,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	20101212+dfsg1-6	19,8 ko	94,0 ko	[liste des fichiers]
i386	20101212+dfsg1-6	20,0 ko	98,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	20101212+dfsg1-6	21,4 ko	100,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	20101212+dfsg1-3	19,8 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	20101212+dfsg1-6	20,3 ko	148,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	20101212+dfsg1-6	20,8 ko	147,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	20101212+dfsg1-6	20,7 ko	147,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	20101212+dfsg1-6	19,8 ko	95,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	20101212+dfsg1-6	20,2 ko	98,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	20101212+dfsg1-6	19,7 ko	146,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	20101212+dfsg1-6	19,5 ko	1 107,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	20101212+dfsg1-6	19,6 ko	98,0 ko	[liste des fichiers]