Pacote: nast-ier (20101212+dfsg1-6 e outros)

[ Fonte: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Outros pacotes relacionados a nast-ier

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, m68k, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Download de nast-ier

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	20101212+dfsg1-6	20.1 kB	147.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	20101212+dfsg1-6	19.9 kB	99.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	20101212+dfsg1-6+b1	20.0 kB	148.0 kB	[lista de arquivos]
armel	20101212+dfsg1-6	19.2 kB	94.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	20101212+dfsg1-6	19.0 kB	90.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	20101212+dfsg1-6	19.8 kB	94.0 kB	[lista de arquivos]
i386	20101212+dfsg1-6	20.0 kB	98.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	20101212+dfsg1-6	21.4 kB	100.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	20101212+dfsg1-6	19.7 kB	99.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	20101212+dfsg1-3	19.8 kB	99.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	20101212+dfsg1-6	20.3 kB	148.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	20101212+dfsg1-6	20.8 kB	147.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	20101212+dfsg1-6	20.7 kB	147.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	20101212+dfsg1-6	19.8 kB	95.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	20101212+dfsg1-6	20.2 kB	98.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	20101212+dfsg1-6	19.7 kB	146.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	20101212+dfsg1-6	19.5 kB	1,107.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	20101212+dfsg1-6	19.6 kB	98.0 kB	[lista de arquivos]