Pakiet: nast-ier (20101212+dfsg1-5)

[ Pakiet źródłowy: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Inne pakiety związane z nast-ier

• dep: cdbfasta

  Narzędzia do indeksowania i przeszukiwania CDB z plików multi-Fasta

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie arm64, ppc64el]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Pobieranie nast-ier

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	21,0 KiB	101,0 KiB	[lista plików]
arm64	20,7 KiB	96,0 KiB	[lista plików]
armel	20,3 KiB	96,0 KiB	[lista plików]
armhf	20,1 KiB	92,0 KiB	[lista plików]
i386	21,3 KiB	100,0 KiB	[lista plików]
mips64el	21,4 KiB	102,0 KiB	[lista plików]
mipsel	21,2 KiB	97,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	21,9 KiB	149,0 KiB	[lista plików]
s390x	20,9 KiB	100,0 KiB	[lista plików]