Pakiet: libssw0 (1.1-15 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armel, armhf, ia64, m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: zlib1g

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie libssw0

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.1-15+b2	25,1 KiB	85,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.1-15+b2	21,3 KiB	64,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.1-15+b2	19,6 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
armel	1.1-15+b2	20,9 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.1-15+b2	21,2 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
i386	1.1-15+b2	26,1 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.1-14	28,7 KiB	89,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.1-15+b2	20,5 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.1-15+b2	23,0 KiB	68,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.1-15+b2	25,5 KiB	86,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.1-15+b2	25,2 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.1-15+b2	22,3 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.1-15+b2	25,3 KiB	60,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.1-15+b2	25,5 KiB	68,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.1-15+b2	27,9 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.1-15+b2	23,8 KiB	1 046,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.1-15+b2	21,2 KiB	60,0 KiB	[lista plików]