Pakiet: libssw0 (1.1-15 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie libssw0

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.1-15+b2	21,3 KiB	64,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.1-15+b2	19,6 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
armel	1.1-15+b2	20,9 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.1-15+b2	21,2 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
i386	1.1-15+b2	26,1 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.1-15+b2	25,5 KiB	86,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.1-15+b2	22,3 KiB	84,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.1-15+b2	25,3 KiB	60,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.1-15+b2	25,5 KiB	68,0 KiB	[lista plików]