Пакет: libssw0 (1.1-15 и другие)

[ Источник: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Теги: Роль: Динамическая библиотека

Другие пакеты, относящиеся к libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf, ia64, m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: zlib1g

  библиотека сжатия

Загрузка libssw0

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.1-15	24,1 Кб	84,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.1-15+b1	21,2 Кб	64,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.1-15+b1	19,5 Кб	84,0 Кб	[список файлов]
armel	1.1-15+b1	20,8 Кб	60,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.1-15+b1	21,1 Кб	52,0 Кб	[список файлов]
i386	1.1-15+b1	26,1 Кб	84,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.1-14	28,7 Кб	89,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.1-15+b1	22,9 Кб	68,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.1-15+b1	25,2 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.1-15+b1	25,2 Кб	84,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.1-15+b1	22,2 Кб	84,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.1-15+b1	25,3 Кб	60,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.1-15+b1	25,5 Кб	68,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.1-15+b1	27,9 Кб	84,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.1-15+b1	23,8 Кб	1 046,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.1-15+b1	21,2 Кб	60,0 Кб	[список файлов]