套件：libssw0（1.1-15 以及其他的）

[ 原始碼： libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

標籤: 角色: 共用函式庫

其他與 libssw0 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [除 armel, armhf, ia64, m68k]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 libssw0

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.1-15+b2	25。1 kB	85。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.1-15+b2	21。3 kB	64。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.1-15+b2	19。6 kB	84。0 kB	[檔案列表]
armel	1.1-15+b2	20。9 kB	84。0 kB	[檔案列表]
armhf	1.1-15+b2	21。2 kB	84。0 kB	[檔案列表]
i386	1.1-15+b2	26。1 kB	84。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	1.1-14	28。7 kB	89。0 kB	[檔案列表]
loong64 （非官方移植版）	1.1-15+b2	20。5 kB	84。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	1.1-15+b2	23。0 kB	68。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.1-15+b2	25。5 kB	86。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.1-15+b2	25。2 kB	84。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.1-15+b2	22。3 kB	84。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.1-15+b2	25。3 kB	60。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.1-15+b2	25。5 kB	68。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.1-15+b2	27。9 kB	84。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.1-15+b2	23。8 kB	1，046。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.1-15+b2	21。2 kB	60。0 kB	[檔案列表]