Pakiet: porechop (0.2.4+dfsg-8)

[ Pakiet źródłowy: porechop  ]

Pakiet eksperymentalny

Ostrzeżenie: Pakiet pochodzi z dystrybucji eksperymentalnej. Oznacza to, że prawdopodobnie jest niestabilny lub zawiera błędy i może spowodować nawet utratę danych. Przed użyciem pakietu proszę koniecznie zapoznać się z dziennikiem zmian i inną dostępną dokumentacją.

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Inne pakiety związane z porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, hppa, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

Pobieranie porechop

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	56,4 KiB	237,0 KiB	[lista plików]
arm64	53,2 KiB	225,0 KiB	[lista plików]
armel	51,1 KiB	217,0 KiB	[lista plików]
armhf	51,3 KiB	205,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	55,6 KiB	226,0 KiB	[lista plików]
i386	57,4 KiB	237,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	53,1 KiB	225,0 KiB	[lista plików]
mips64el	53,9 KiB	292,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	57,6 KiB	290,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	57,8 KiB	289,0 KiB	[lista plików]
riscv64	55,8 KiB	213,0 KiB	[lista plików]
s390x	56,9 KiB	237,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	59,0 KiB	225,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	51,3 KiB	1 187,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	56,3 KiB	233,0 KiB	[lista plików]