[ Source: porechop ]
Пакунок: porechop (0.2.4+dfsg-8)
Links for porechop
Debian Resources:
Download Source Package porechop:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rrwick.github.io]
Similar packages:
Експериментальний пакунок
Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.
adapter trimmer for Oxford Nanopore reads
Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.
Інші пакунки пов'язані з porechop
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, hppa, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, m68k]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (>= 3~)
Завантажити porechop
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 56.4 kB | 237.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 53.2 kB | 225.0 kB | [список файлів] |
| armel | 51.1 kB | 217.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 51.3 kB | 205.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 55.6 kB | 226.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 57.4 kB | 237.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 53.1 kB | 225.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 53.9 kB | 292.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 57.6 kB | 290.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 57.8 kB | 289.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 55.8 kB | 213.0 kB | [список файлів] |
| s390x | 56.9 kB | 237.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 59.0 kB | 225.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 51.3 kB | 1,187.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 56.3 kB | 233.0 kB | [список файлів] |