Paquet : porechop (0.2.4+dfsg-8)

[ Paquet source : porechop  ]

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Autres paquets associés à porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, hppa, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

Télécharger porechop

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	56,4 ko	237,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	53,2 ko	225,0 ko	[liste des fichiers]
armel	51,1 ko	217,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	51,3 ko	205,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	55,6 ko	226,0 ko	[liste des fichiers]
i386	57,4 ko	237,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	53,1 ko	225,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	53,9 ko	292,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	57,6 ko	290,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	57,8 ko	289,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	55,8 ko	213,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	56,9 ko	237,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	59,0 ko	225,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	51,3 ko	1 187,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	56,3 ko	233,0 ko	[liste des fichiers]