Pakiet: porechop (0.2.4+dfsg-5)

[ Pakiet źródłowy: porechop  ]

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Inne pakiety związane z porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (>= 3~)

Pobieranie porechop

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	55,8 KiB	242,0 KiB	[lista plików]
arm64	52,7 KiB	226,0 KiB	[lista plików]
armel	50,9 KiB	221,0 KiB	[lista plików]
armhf	51,1 KiB	205,0 KiB	[lista plików]
i386	56,8 KiB	237,0 KiB	[lista plików]
mips64el	52,8 KiB	231,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	57,9 KiB	290,0 KiB	[lista plików]
s390x	57,4 KiB	242,0 KiB	[lista plików]