Paket: porechop (0.2.4+dfsg-8)

[ Quellcode: porechop  ]

Experimentelles Paket

Warnung: Dieses Paket stammt aus der Experimental-Distribution. Dies bedeutet, dass es höchstwahrscheinlich instabil oder fehlerhaft ist und sogar Datenverlust verursachen kann. Bitte lesen Sie den Changelog und andere möglicherweise verfügbare Dokumentation, bevor Sie es benutzen.

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Andere Pakete mit Bezug zu porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nicht amd64, arm64, hppa, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, m68k]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

porechop herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	56,4 kB	237,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	53,2 kB	225,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	51,1 kB	217,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	51,3 kB	205,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	55,6 kB	226,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	57,4 kB	237,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	53,1 kB	225,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	53,9 kB	292,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	57,6 kB	290,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	57,8 kB	289,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	55,8 kB	213,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	56,9 kB	237,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	59,0 kB	225,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	51,3 kB	1.187,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	56,3 kB	233,0 kB	[Liste der Dateien]