套件：kalign（1:3.3-1 以及其他的）

[ 原始碼： kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

標籤: 生物學: Clustal/ALN, 蛋白質, 領域: field::biology, field::biology:bioinformatics, 實做語言: implemented-in::c, interface::commandline, 角色: 程式, 範圍: 實用程式, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, 處理: 需要一個額外的標籤

其他與 kalign 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

下載 kalign

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
amd64	1:3.3-1+b3	133。4 kB	1，144。0 kB	[檔案列表]
arm64	1:3.3-1+b3	72。2 kB	217。0 kB	[檔案列表]
armel	1:3.3-1+b3	70。2 kB	207。0 kB	[檔案列表]
armhf	1:3.3-1+b3	67。5 kB	171。0 kB	[檔案列表]
i386	1:3.3-1+b3	173。4 kB	1，572。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1:3.3-1+b3	71。1 kB	223。0 kB	[檔案列表]
mipsel	1:3.3-1+b3	71。7 kB	216。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1:3.3-1+b3	85。0 kB	341。0 kB	[檔案列表]
s390x	1:3.3-1+b3	73。3 kB	241。0 kB	[檔案列表]