Paketti: kalign (1:3.3-1 ja muut)

[ Source: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Tagit: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Muut pakettiin kalign liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Imuroi kalign

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1:3.3-1+b3	133.4 kt	1,144.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1:3.3-1+b3	72.2 kt	217.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1:3.3-1+b3	70.2 kt	207.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1:3.3-1+b3	67.5 kt	171.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1:3.3-1+b3	173.4 kt	1,572.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1:3.3-1+b3	71.1 kt	223.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1:3.3-1+b3	71.7 kt	216.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1:3.3-1+b3	85.0 kt	341.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1:3.3-1+b3	73.3 kt	241.0 kt	[tiedostoluettelo]