パッケージ: kalign (1:3.3-1 など)

[ ソース: kalign  ]

グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント

Kalign は、生物学的配列の多重アライメント実行用コマンドラインツールです。ア ライメントの正確さと速度の両方を改善するため、Muth-Manber の文字列照合アル ゴリズムを使用します。グローバルかつプログレッシブなアライメント手法を利用 しており、その上で、配列間距離の計算への近似文字列照合アルゴリズムの使用 と、ローカルのマッチを別のグローバルアライメントに組み込むことにより、機能 がさらに強化されています。

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の kalign 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

kalign のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1:3.3-1+b3	133.4 kB	1,144.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1:3.3-1+b3	72.2 kB	217.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1:3.3-1+b3	70.2 kB	207.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1:3.3-1+b3	67.5 kB	171.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1:3.3-1+b3	173.4 kB	1,572.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1:3.3-1+b3	71.1 kB	223.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1:3.3-1+b3	71.7 kB	216.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1:3.3-1+b3	85.0 kB	341.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1:3.3-1+b3	73.3 kB	241.0 kB	[ファイル一覧]