Pakiet: covtobed (1.3.5+dfsg-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Inne pakiety związane z covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: zlib1g

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie covtobed

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.3.5+dfsg-2	45,8 KiB	211,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.3.5+dfsg-2	49,8 KiB	146,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.3.5+dfsg-2+b1	45,0 KiB	147,0 KiB	[lista plików]
armel	1.3.5+dfsg-2	42,8 KiB	125,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.3.5+dfsg-2	44,6 KiB	97,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.3.5+dfsg-2	45,5 KiB	123,0 KiB	[lista plików]
i386	1.3.5+dfsg-2	53,4 KiB	149,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.3.5+dfsg-2	57,1 KiB	240,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.3.5+dfsg-2	47,0 KiB	137,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.3.5+dfsg-2	46,4 KiB	215,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.3.5+dfsg-2	49,7 KiB	210,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.3.5+dfsg-2	49,7 KiB	210,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.3.5+dfsg-2+b1	48,2 KiB	111,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.3.5+dfsg-2	46,3 KiB	138,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.3.5+dfsg-2	54,0 KiB	145,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.3.5+dfsg-2	39,5 KiB	1 045,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.3.5+dfsg-2	50,4 KiB	133,0 KiB	[lista plików]