パッケージ: mustang (3.2.4-1 など)

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類似のパッケージ:

multiple structural alignment of proteins

Mustang is an algorithm to align multiple protein structures. Given a set of PDB files, the program uses the spatial information in the Calpha atoms of the set to produce a sequence alignment. Based on a progressive pairwise heuristic the algorithm then proceeds through a number of refinement passes. Mustang reports the multiple sequence alignment and the corresponding superposition of structures.

タグ: 生物学: タンパク質, 分野: 生物学, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::program, use::analysing, 目的: 比較, サポート形式: プレーンテキスト

その他の mustang 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, arm64, ia64, loong64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [loong64, sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 11) [arm64, riscv64 以外]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

sug: mustang-testdata

multiple structural alignment of proteins, test data

mustang のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	3.2.4-1	103.7 kB	458.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	3.2.4-1	102.8 kB	366.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	3.2.4-1+b1	95.7 kB	394.0 kB	[ファイル一覧]
armel	3.2.4-1	93.7 kB	393.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	3.2.4-1	92.2 kB	329.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	3.2.4-1	99.3 kB	362.0 kB	[ファイル一覧]
i386	3.2.4-1	105.4 kB	381.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	3.2.4-1	124.5 kB	554.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	3.2.4-1	97.1 kB	378.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	3.2.4-1	98.2 kB	369.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	3.2.4-1	102.3 kB	466.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	3.2.4-1	111.4 kB	458.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	3.2.4-1	111.8 kB	458.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	3.2.4-1+b1	107.3 kB	342.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	3.2.4-1	98.4 kB	381.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	3.2.4-1	113.4 kB	393.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	3.2.4-1	93.8 kB	1,227.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	3.2.4-1	101.9 kB	365.0 kB	[ファイル一覧]