Paket: mustang (3.2.4-1 und andere)

[ Quellcode: mustang  ]

Struktur-Alignment mehrerer Proteine

Mustang ist ein Algorithmus, um mehrere Protein-Strukturen miteinander abzugleichen. Aus einem Satz von PDB-Dateien (Protein Data Bank, PDB) bestimmt das Programm unter Ausnutzung der räumlichen Informationen in den Calpha-Atomen die einander zuzuordnenden Aminosäuren. Dies ist für verschiedene Bereiche des Proteins auch unterschiedlich gut möglich. Anschließend werden die Proteine paarweise miteinander verglichen, und so in mehreren Durchgängen mit einer Heuristik das Ergebnis zunehmend verfeinert. Schließlich gibt Mustang die Zuordnung der Protein-Sequenzen (das Alignment) und auch die entsprechende räumliche Überlagerung von Strukturen aus.

Markierungen: Biologie: Proteine, Feld: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: role::program, use::analysing, Zweck: Vergleichen, Unterstützt Formate: Reiner Text

Andere Pakete mit Bezug zu mustang

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nicht riscv64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• sug: mustang-testdata

  multiple structural alignment of proteins, test data

mustang herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	3.2.4-1	103,7 kB	458,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	3.2.4-1	102,8 kB	366,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	3.2.4-1	94,9 kB	393,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	3.2.4-1	93,7 kB	393,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	3.2.4-1	92,2 kB	329,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	3.2.4-1	99,3 kB	362,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	3.2.4-1	105,4 kB	381,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	3.2.4-1	124,5 kB	554,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	3.2.4-1	98,2 kB	369,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	3.2.4-1	102,3 kB	466,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	3.2.4-1	111,4 kB	458,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	3.2.4-1	111,8 kB	458,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	3.2.4-1+b1	107,3 kB	342,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	3.2.4-1	98,4 kB	381,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	3.2.4-1	113,4 kB	393,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	3.2.4-1	93,8 kB	1.227,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	3.2.4-1	101,9 kB	365,0 kB	[Liste der Dateien]