パッケージ: mustang (3.2.4-1 など)

[ ソース: mustang  ]

multiple structural alignment of proteins

Mustang is an algorithm to align multiple protein structures. Given a set of PDB files, the program uses the spatial information in the Calpha atoms of the set to produce a sequence alignment. Based on a progressive pairwise heuristic the algorithm then proceeds through a number of refinement passes. Mustang reports the multiple sequence alignment and the corresponding superposition of structures.

タグ: 生物学: タンパク質, 分野: 生物学, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::program, use::analysing, 目的: 比較, サポート形式: プレーンテキスト

その他の mustang 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [arm64 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [arm64, riscv64 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• sug: mustang-testdata

  multiple structural alignment of proteins, test data

mustang のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	3.2.4-1	102.8 kB	366.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	3.2.4-1+b1	95.7 kB	394.0 kB	[ファイル一覧]
armel	3.2.4-1	93.7 kB	393.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	3.2.4-1	92.2 kB	329.0 kB	[ファイル一覧]
i386	3.2.4-1	105.4 kB	381.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	3.2.4-1	102.3 kB	466.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	3.2.4-1	111.8 kB	458.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	3.2.4-1+b1	107.3 kB	342.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	3.2.4-1	98.4 kB	381.0 kB	[ファイル一覧]