Pakiet: mustang (3.2.4-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: mustang  ]

Wielokrotne strukturalne dopasowanie białek

Mustang to algorytm dopasowywania wielu struktur białkowych. Program wykorzystuje informacje przestrzenne zawarte w atomach Calpha z zestawu plików PDB w celu uzyskania dopasowania sekwencji. W oparciu o progresywną heurystykę dopasowywania parami algorytm przechodzi przez szereg przejść udoskonalających. Mustang raportuje dopasowanie wielu sekwencji i odpowiednią superpozycję struktur.

Znaczniki: Biologia: Białka, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, use::analysing, Przeznaczenie: Porównywanie, Obsługa formatu: Czysty tekst

Inne pakiety związane z mustang

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie arm64, riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• sug: mustang-testdata

  multiple structural alignment of proteins, test data

Pobieranie mustang

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.2.4-1	103,7 KiB	458,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.2.4-1	102,8 KiB	366,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.2.4-1+b1	95,7 KiB	394,0 KiB	[lista plików]
armel	3.2.4-1	93,7 KiB	393,0 KiB	[lista plików]
armhf	3.2.4-1	92,2 KiB	329,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	3.2.4-1	99,3 KiB	362,0 KiB	[lista plików]
i386	3.2.4-1	105,4 KiB	381,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	3.2.4-1	124,5 KiB	554,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	3.2.4-1	97,1 KiB	378,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	3.2.4-1	98,2 KiB	369,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3.2.4-1	102,3 KiB	466,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.2.4-1	111,4 KiB	458,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.2.4-1	111,8 KiB	458,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.2.4-1+b1	107,3 KiB	342,0 KiB	[lista plików]
s390x	3.2.4-1	98,4 KiB	381,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	3.2.4-1	113,4 KiB	393,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.2.4-1	93,8 KiB	1 227,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	3.2.4-1	101,9 KiB	365,0 KiB	[lista plików]