Paketti: mustang (3.2.4-1 ja muut)

[ Source: mustang  ]

multiple structural alignment of proteins

Mustang is an algorithm to align multiple protein structures. Given a set of PDB files, the program uses the spatial information in the Calpha atoms of the set to produce a sequence alignment. Based on a progressive pairwise heuristic the algorithm then proceeds through a number of refinement passes. Mustang reports the multiple sequence alignment and the corresponding superposition of structures.

Tagit: Biology: Proteins, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Comparing, Supports Format: Plain Text

Muut pakettiin mustang liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, arm64, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ei arm64, riscv64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: mustang-testdata

  multiple structural alignment of proteins, test data

Imuroi mustang

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	3.2.4-1	103.7 kt	458.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	3.2.4-1	102.8 kt	366.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	3.2.4-1+b1	95.7 kt	394.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	3.2.4-1	93.7 kt	393.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	3.2.4-1	92.2 kt	329.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	3.2.4-1	99.3 kt	362.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	3.2.4-1	105.4 kt	381.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	3.2.4-1	124.5 kt	554.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	3.2.4-1	98.2 kt	369.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	3.2.4-1	102.3 kt	466.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	3.2.4-1	111.4 kt	458.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	3.2.4-1	111.8 kt	458.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	3.2.4-1+b1	107.3 kt	342.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	3.2.4-1	98.4 kt	381.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	3.2.4-1	113.4 kt	393.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	3.2.4-1	93.8 kt	1,227.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	3.2.4-1	101.9 kt	365.0 kt	[tiedostoluettelo]