Balík: mustang (3.2.4-1 a iné)

[ Zdroj: mustang  ]

multiple structural alignment of proteins

Mustang is an algorithm to align multiple protein structures. Given a set of PDB files, the program uses the spatial information in the Calpha atoms of the set to produce a sequence alignment. Based on a progressive pairwise heuristic the algorithm then proceeds through a number of refinement passes. Mustang reports the multiple sequence alignment and the corresponding superposition of structures.

Značky: Biológia: Proteins, Pole: Biológia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Porovnávanie, Supports Format: Plain Text

Ostatné balíky súvisiace s balíkom mustang

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, arm64, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie arm64, riscv64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• sug: mustang-testdata

  multiple structural alignment of proteins, test data

Stiahnuť mustang

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	3.2.4-1	103.7 kB	458.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	3.2.4-1	102.8 kB	366.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	3.2.4-1+b1	95.7 kB	394.0 kB	[zoznam súborov]
armel	3.2.4-1	93.7 kB	393.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	3.2.4-1	92.2 kB	329.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	3.2.4-1	99.3 kB	362.0 kB	[zoznam súborov]
i386	3.2.4-1	105.4 kB	381.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	3.2.4-1	124.5 kB	554.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	3.2.4-1	98.2 kB	369.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	3.2.4-1	102.3 kB	466.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	3.2.4-1	111.4 kB	458.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	3.2.4-1	111.8 kB	458.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	3.2.4-1+b1	107.3 kB	342.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	3.2.4-1	98.4 kB	381.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	3.2.4-1	113.4 kB	393.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	3.2.4-1	93.8 kB	1,227.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	3.2.4-1	101.9 kB	365.0 kB	[zoznam súborov]