Paket: mustang (3.2.4-1 och andra)

[ Källkod: mustang  ]

multiple structural alignment of proteins

Mustang is an algorithm to align multiple protein structures. Given a set of PDB files, the program uses the spatial information in the Calpha atoms of the set to produce a sequence alignment. Based on a progressive pairwise heuristic the algorithm then proceeds through a number of refinement passes. Mustang reports the multiple sequence alignment and the corresponding superposition of structures.

Märken: Biologi: Proteiner, Field: Biologi, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Comparing, Supports Format: Plain Text

Andra paket besläktade med mustang

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, arm64, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ej arm64, riscv64]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: mustang-testdata

  multiple structural alignment of proteins, test data

Hämta mustang

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	3.2.4-1	103,7 kbyte	458,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	3.2.4-1	102,8 kbyte	366,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	3.2.4-1+b1	95,7 kbyte	394,0 kbyte	[filförteckning]
armel	3.2.4-1	93,7 kbyte	393,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	3.2.4-1	92,2 kbyte	329,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	3.2.4-1	99,3 kbyte	362,0 kbyte	[filförteckning]
i386	3.2.4-1	105,4 kbyte	381,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	3.2.4-1	124,5 kbyte	554,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	3.2.4-1	98,2 kbyte	369,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	3.2.4-1	102,3 kbyte	466,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	3.2.4-1	111,4 kbyte	458,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	3.2.4-1	111,8 kbyte	458,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	3.2.4-1+b1	107,3 kbyte	342,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	3.2.4-1	98,4 kbyte	381,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	3.2.4-1	113,4 kbyte	393,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	3.2.4-1	93,8 kbyte	1.227,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	3.2.4-1	101,9 kbyte	365,0 kbyte	[filförteckning]