[ ソース: hilive ]
パッケージ: hilive (2.0a-5)
試験的な (experimental の) パッケージ
警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。
realtime alignment of Illumina reads
HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.
その他の hilive 関連パッケージ
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- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
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- dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.38) [sh4 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, x32]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)
- 高速な LZ 圧縮アルゴリズムライブラリ - ランタイム
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [m68k 以外]
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
hilive のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 558.5 kB | 2,553.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 494.1 kB | 2,433.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 473.6 kB | 2,323.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 493.0 kB | 1,643.0 kB | [ファイル一覧] |
| hppa (非公式の移植版) | 501.2 kB | 2,421.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 568.8 kB | 2,675.0 kB | [ファイル一覧] |
| m68k (非公式の移植版) | 393.2 kB | 2,223.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 499.5 kB | 3,481.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64 (非公式の移植版) | 521.0 kB | 3,265.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 535.3 kB | 3,073.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 563.5 kB | 1,973.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 527.9 kB | 2,589.0 kB | [ファイル一覧] |
| sh4 (非公式の移植版) | 486.6 kB | 2,113.0 kB | [ファイル一覧] |
| sparc64 (非公式の移植版) | 439.3 kB | 3,151.0 kB | [ファイル一覧] |
| x32 (非公式の移植版) | 529.6 kB | 2,391.0 kB | [ファイル一覧] |