Paquet : hilive (2.0a-5)

[ Paquet source : hilive  ]

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

alignement en temps réel des lectures Illumina

HiLive est un outil de mappage de lectures qui mappe les lectures d’HiSeq d’Illumina (ou comparables) à une référence de génome au moment où elles sont faites. Cela signifie que le mappage de lectures se termine aussitôt que le séquenceur a fini de générer des données.

Autres paquets associés à hilive

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliothèque d'options de programmes pour C++

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, loong64, ppc64el, s390x]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)

  bibliothèque de l'algorithme de compression Fast LZ –⋅exécutable

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non m68k]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger hilive

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	519,5 ko	2 952,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	558,5 ko	2 553,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	494,1 ko	2 433,0 ko	[liste des fichiers]
armel	473,6 ko	2 323,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	493,0 ko	1 643,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	501,2 ko	2 421,0 ko	[liste des fichiers]
i386	568,8 ko	2 675,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	516,0 ko	2 417,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	393,2 ko	2 223,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	499,5 ko	3 481,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	521,0 ko	3 265,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	535,3 ko	3 073,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	563,5 ko	1 973,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	527,9 ko	2 589,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	486,6 ko	2 113,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	439,3 ko	3 151,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	529,6 ko	2 391,0 ko	[liste des fichiers]