Пакунок: hilive (2.0a-5)

[ Source: hilive  ]

Експериментальний пакунок

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

realtime alignment of Illumina reads

HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.

Інші пакунки пов'язані з hilive

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  Операції з файловою системою (переносимі шляхи, операції з теками тощо) на Сі++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  Бібліотека параметрів програми на Сі++

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6 (>= 2.38) [not sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)

  Бібліотека швидкого алгоритму стиснення LZ — виконавчі файли

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [not m68k]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити hilive

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	558.5 kB	2,553.0 kB	[список файлів]
arm64	494.1 kB	2,433.0 kB	[список файлів]
armel	473.6 kB	2,323.0 kB	[список файлів]
armhf	493.0 kB	1,643.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	501.2 kB	2,421.0 kB	[список файлів]
i386	568.8 kB	2,675.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	393.2 kB	2,223.0 kB	[список файлів]
mips64el	499.5 kB	3,481.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	521.0 kB	3,265.0 kB	[список файлів]
ppc64el	535.3 kB	3,073.0 kB	[список файлів]
riscv64	563.5 kB	1,973.0 kB	[список файлів]
s390x	527.9 kB	2,589.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	486.6 kB	2,113.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	439.3 kB	3,151.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	529.6 kB	2,391.0 kB	[список файлів]