Pakiet: hilive (2.0a-5)

[ Pakiet źródłowy: hilive  ]

Pakiet eksperymentalny

Ostrzeżenie: Pakiet pochodzi z dystrybucji eksperymentalnej. Oznacza to, że prawdopodobnie jest niestabilny lub zawiera błędy i może spowodować nawet utratę danych. Przed użyciem pakietu proszę koniecznie zapoznać się z dziennikiem zmian i inną dostępną dokumentacją.

realtime alignment of Illumina reads

HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.

Inne pakiety związane z hilive

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)

  Biblioteka szybkiego algorytmu kompresji LZ - uruchomieniowa

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie m68k]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie hilive

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	558,5 KiB	2 553,0 KiB	[lista plików]
arm64	494,1 KiB	2 433,0 KiB	[lista plików]
armel	473,6 KiB	2 323,0 KiB	[lista plików]
armhf	493,0 KiB	1 643,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	501,2 KiB	2 421,0 KiB	[lista plików]
i386	568,8 KiB	2 675,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	393,2 KiB	2 223,0 KiB	[lista plików]
mips64el	499,5 KiB	3 481,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	521,0 KiB	3 265,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	535,3 KiB	3 073,0 KiB	[lista plików]
riscv64	563,5 KiB	1 973,0 KiB	[lista plików]
s390x	527,9 KiB	2 589,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	486,6 KiB	2 113,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	439,3 KiB	3 151,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	529,6 KiB	2 391,0 KiB	[lista plików]