パッケージ: hilive (2.0a-4 など)

[ ソース: hilive  ]

realtime alignment of Illumina reads

HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.

その他の hilive 関連パッケージ

• dep: libboost-atomic1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  atomic data types, operations, and memory ordering constraints

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Boost.Iostreams ライブラリ

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++ 用プログラムオプションライブラリ

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Operating system (e.g. diagnostics support) library

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4 以外]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)

  高速な LZ 圧縮アルゴリズムライブラリ - ランタイム

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, x32 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

hilive のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.0a-4	481.4 kB	2,824.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.0a-4	517.9 kB	2,377.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.0a-4+b1	476.1 kB	2,434.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.0a-4	443.7 kB	2,199.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.0a-4	457.5 kB	1,555.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.0a-4	474.7 kB	2,325.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.0a-4	526.7 kB	2,511.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.0a-3+b3	612.9 kB	5,084.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.0a-4	385.9 kB	2,175.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.0a-4	472.6 kB	3,289.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.0a-4	489.8 kB	3,137.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.0a-4	502.6 kB	2,881.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.0a-4	526.0 kB	1,893.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.0a-4	492.3 kB	2,453.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.0a-4	452.7 kB	2,049.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.0a-4	416.9 kB	3,151.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.0a-4+b1	508.1 kB	2,308.0 kB	[ファイル一覧]