Paketti: hilive (2.0a-5)

[ Source: hilive  ]

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

realtime alignment of Illumina reads

HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.

Muut pakettiin hilive liittyvät paketit

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.38) [ei sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)

  Fast LZ compression algorithm library - runtime

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [ei m68k]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi hilive

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	558.5 kt	2,553.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	494.1 kt	2,433.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	473.6 kt	2,323.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	493.0 kt	1,643.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	501.2 kt	2,421.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	568.8 kt	2,675.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	393.2 kt	2,223.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	499.5 kt	3,481.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	521.0 kt	3,265.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	535.3 kt	3,073.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	563.5 kt	1,973.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	527.9 kt	2,589.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	486.6 kt	2,113.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	439.3 kt	3,151.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	529.6 kt	2,391.0 kt	[tiedostoluettelo]