Package: macs (3.0.2-1 and others)

[ Source: macs  ]

Modelbaseret analyse af ChIP-Seq på korte læsesekvenser

MACS opbygger empirisk længden af de sekventerede ChIP-fragmenter, som tenderer til at være kortere end lydbehandling eller størrelsesestimater for bibliotekskonstruktion og bruger den til at forbedre den rumlige opløsning af forudsagte bindingssteder. MACS bruger også en dynamisk Poisson-fordeling til effektivt at fange lokale skævheder i arvemassesekvensen, hvilket giver mulighed for mere følsom og robust forudsigelse. MACS sammenligner positivt til eksisterende ChIP-Seq peak-finding-algoritmer, er offentligt tilgængelig åben kildekode og kan bruges til ChIP-Seq med eller uden kontrolprøver.

Other Packages Related to macs

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-cykhash

  cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique

• dep: python3-hmmlearn

  Læring uden overvågning og inferens for Hidden Markov-modeller

• dep: python3-numpy

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

• dep: python3-numpy2-abi0

  virtual package provided by python3-numpy

  or python3-numpy-abi9

  Package not available

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

• dep: python3-sklearn

  Pythonmoduler for maskinlæring og dataundersøgelse - Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf]

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

Download macs

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3.0.2-1+b3	3,047.7 kB	8,250.0 kB	[list of files]
arm64	3.0.2-1+b3	2,788.5 kB	8,056.0 kB	[list of files]
armel	3.0.2-1+b3	2,800.3 kB	8,452.0 kB	[list of files]
armhf	3.0.2-1+b3	2,858.6 kB	6,788.0 kB	[list of files]
i386	3.0.2-1+b3	3,008.0 kB	8,708.0 kB	[list of files]
ppc64el	3.0.2-1+b3	2,929.5 kB	9,720.0 kB	[list of files]
riscv64	3.0.2-1+b3	3,062.1 kB	6,644.0 kB	[list of files]
s390x	3.0.2-1+b3	2,873.7 kB	8,082.0 kB	[list of files]