Package: edlib-aligner (1.2.7-6 and others)

[ Source: libedlib  ]

strumento edlib per allineamento di sequenze usando la distanza di modifica

Edlib è una libreria C/C++ leggera e super-veloce per l'allineamento di sequenze usando la distanza di modifica. Questo pacchetto fornisce uno strumento per allineamento che usa tale libreria.

Funzionalità di libedlib:

 * Calcolo della distanza di modifica (distanza di Levehnstein).
 * Può trovare il percorso ottimale di allineamento (istruzioni su come
   trasformare la prima sequenza nella seconda sequenza).
 * Può trovare solo le posizioni iniziali o quelle finali, o entrambe, di
   un percorso di allineamento (può essere utile quando la velocità è più
   importante che avere un percorso di allineamento esatto).
 * Gestisce più metodi di allineamento: globale(NW), prefisso(SHW) e
   infisso(HW), ciascuno utile per differenti scenari.
 * Si può estendere la definizione dell'uguaglianza dei caratteri,
   abilitando ad esempio i metacaratteri, per ottenere un allineamento
   indifferente a maiuscole e minuscole o per lavorare con nucleotidi
   degenerati.
 * Può gestire sequenze piccole o molto grandi, anche per la ricerca del
   percorso di allineamento, consumando pochissima memoria.
 * Super-veloce grazie all'algoritmo di Myers per vettori di bit.

Other Packages Related to edlib-aligner

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

  libreria per allineamento di sequenze usando la distanza di modifica

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b2) [not ia64, x32]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

Download edlib-aligner

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.2.7-6+b2	22.3 kB	87.0 kB	[list of files]
amd64	1.2.7-6+b2	24.4 kB	71.0 kB	[list of files]
arm64	1.2.7-6+b2	23.0 kB	87.0 kB	[list of files]
armel	1.2.7-6+b2	21.3 kB	58.0 kB	[list of files]
armhf	1.2.7-6+b2	20.4 kB	46.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.2.7-6+b2	22.9 kB	55.0 kB	[list of files]
i386	1.2.7-6+b2	23.7 kB	62.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.2.7-5	27.5 kB	86.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.2.7-6+b2	22.5 kB	62.0 kB	[list of files]
mips64el	1.2.7-6+b2	22.2 kB	88.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.2.7-6+b2	24.1 kB	87.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.2.7-6+b2	26.2 kB	87.0 kB	[list of files]
riscv64	1.2.7-6+b2	21.3 kB	51.0 kB	[list of files]
s390x	1.2.7-6+b2	25.2 kB	67.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.2.7-6+b2	25.0 kB	86.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.2.7-6+b2	20.8 kB	1,048.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.2.7-5+b1	24.3 kB	66.0 kB	[list of files]