Pakiet: edlib-aligner (1.2.7-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libedlib  ]

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Inne pakiety związane z edlib-aligner

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

  library for sequence alignment using edit distance

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b2) [nie ia64, x32]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie edlib-aligner

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.2.7-6+b2	22,3 KiB	87,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.2.7-6+b2	24,4 KiB	71,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.2.7-6+b2	23,0 KiB	87,0 KiB	[lista plików]
armel	1.2.7-6+b2	21,3 KiB	58,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.2.7-6+b2	20,4 KiB	46,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.2.7-6+b2	22,9 KiB	55,0 KiB	[lista plików]
i386	1.2.7-6+b2	23,7 KiB	62,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.2.7-5	27,5 KiB	86,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.2.7-6+b2	22,5 KiB	62,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.2.7-6+b2	22,2 KiB	88,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.2.7-6+b2	24,1 KiB	87,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.2.7-6+b2	26,2 KiB	87,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.2.7-6+b2	21,3 KiB	51,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.2.7-6+b2	25,2 KiB	67,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.2.7-6+b2	25,0 KiB	86,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.2.7-6+b2	20,8 KiB	1 048,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.2.7-5+b1	24,3 KiB	66,0 KiB	[lista plików]