パッケージ: edlib-aligner (1.2.7-6 など)

edlib-aligner に関するリンク

Debian の資源:

libedlib ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

その他の edlib-aligner 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

library for sequence alignment using edit distance

dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b2) [ia64, x32 以外]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32 以外]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

edlib-aligner のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.2.7-6+b2	22.3 kB	87.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.2.7-6+b2	24.4 kB	71.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.2.7-6+b2	23.0 kB	87.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.2.7-6+b2	21.3 kB	58.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.2.7-6+b2	20.4 kB	46.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.2.7-6+b2	22.9 kB	55.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.2.7-6+b2	23.7 kB	62.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.2.7-5	27.5 kB	86.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.2.7-6+b2	22.5 kB	62.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.2.7-6+b2	22.2 kB	88.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.2.7-6+b2	24.1 kB	87.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.2.7-6+b2	26.2 kB	87.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.2.7-6+b2	21.3 kB	51.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.2.7-6+b2	25.2 kB	67.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.2.7-6+b2	25.0 kB	86.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.2.7-6+b2	20.8 kB	1,048.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.2.7-5+b1	24.3 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]