[ Quellcode: libedlib ]
Paket: edlib-aligner (1.2.7-6 und andere)
Links für edlib-aligner
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket libedlib herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
edlib sequence alignment tool using edit distance
Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.
Features of libedlib
* Calculates edit distance (Levehnstein distance). * It can find optimal alignment path (instructions how to transform first sequence into the second sequence). * It can find just the start and/or end locations of alignment path - can be useful when speed is more important than having exact alignment path. * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and infix(HW), each of them useful for different scenarios. * You can extend character equality definition, enabling you to e.g. have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to work with degenerate nucleotides. * It can easily handle small or very large sequences, even when finding alignment path, while consuming very little memory. * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.
Andere Pakete mit Bezug zu edlib-aligner
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- dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, sh4]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]
- library for sequence alignment using edit distance
- dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]
- dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b3) [nicht ia64, x32]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC Support-Bibliothek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
edlib-aligner herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
---|---|---|---|---|
alpha (inoffizielle Portierung) | 1.2.7-6+b3 | 22,3 kB | 87,0 kB | [Liste der Dateien] |
amd64 | 1.2.7-6+b3 | 24,4 kB | 71,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 1.2.7-6+b3 | 23,0 kB | 87,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 1.2.7-6+b3 | 21,4 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 1.2.7-6+b3 | 20,5 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
hppa (inoffizielle Portierung) | 1.2.7-6+b3 | 23,0 kB | 55,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 1.2.7-6+b3 | 23,7 kB | 62,0 kB | [Liste der Dateien] |
ia64 (inoffizielle Portierung) | 1.2.7-5 | 27,5 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
m68k (inoffizielle Portierung) | 1.2.7-6+b3 | 22,5 kB | 62,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 1.2.7-6+b3 | 22,5 kB | 88,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64 (inoffizielle Portierung) | 1.2.7-6+b3 | 24,1 kB | 87,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 1.2.7-6+b3 | 26,2 kB | 87,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 1.2.7-6+b3 | 21,4 kB | 51,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 1.2.7-6+b3 | 25,2 kB | 67,0 kB | [Liste der Dateien] |
sh4 (inoffizielle Portierung) | 1.2.7-6+b3 | 25,0 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
sparc64 (inoffizielle Portierung) | 1.2.7-6+b3 | 20,8 kB | 1.048,0 kB | [Liste der Dateien] |
x32 (inoffizielle Portierung) | 1.2.7-5+b1 | 24,3 kB | 66,0 kB | [Liste der Dateien] |