Пакет: edlib-aligner (1.2.7-6 и други)

Връзки за edlib-aligner

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник libedlib.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Други пакети, свързани с edlib-aligner

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

library for sequence alignment using edit distance

dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b2) [не ia64, x32]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на edlib-aligner

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.2.7-6+b2	22,3 кБ	87,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.2.7-6+b2	24,4 кБ	71,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.2.7-6+b2	23,0 кБ	87,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.2.7-6+b2	21,3 кБ	58,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.2.7-6+b2	20,4 кБ	46,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.2.7-6+b2	22,9 кБ	55,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.2.7-6+b2	23,7 кБ	62,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.2.7-5	27,5 кБ	86,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.2.7-6+b2	22,5 кБ	62,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.2.7-6+b2	22,2 кБ	88,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.2.7-6+b2	24,1 кБ	87,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.2.7-6+b2	26,2 кБ	87,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.2.7-6+b2	21,3 кБ	51,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.2.7-6+b2	25,2 кБ	67,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.2.7-6+b2	25,0 кБ	86,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.2.7-6+b2	20,8 кБ	1 048,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.2.7-5+b1	24,3 кБ	66,0 кБ	[списък на файловете]