Paquet : dialign-tx (1.0.2-15 et autres)

[ Paquet source : dialign-t  ]

alignement séquentiel multiple basé sur les segments

DIALIGN-TX est un outil en ligne de commandes pour réaliser un alignement multiple de séquences de protéines ou d'ADN. C'est une ré-implémentation complète de l'approche basée sur les segments incluant plusieurs nouvelles améliorations et heuristiques qui améliore significativement la qualité des alignements en sortie comparée à DIALIGN 2.2 et DIALIGN-T. Pour les alignements par paires, DIALIGN-TX utilise un algorithme de « fragment- chaining » qui favorise les chaînes d'alignements locaux de faible score plutôt que les fragments isolés de score élevé. Pour l'alignement multiple, DIALIGN-TX utilise une procédure gloutonne améliorée qui est moins sensible aux fausses similitudes locales des séquences.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::comparing, works-with-format::TODO, Format pris en charge: Texte simple, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-15)

  alignement de plusieurs séquences par segments – fichiers de données

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• enh: t-coffee

  alignement multiple de séquences

Télécharger dialign-tx

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.0.2-15	104,2 ko	275,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.0.2-15	85,5 ko	223,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0.2-15+b1	92,6 ko	212,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.0.2-15	75,1 ko	198,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.0.2-15	66,8 ko	142,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.0.2-15	95,7 ko	211,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.0.2-15	79,5 ko	210,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.0.2-15	151,4 ko	447,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.0.2-15	66,0 ko	194,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0.2-15	99,9 ko	278,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.0.2-15	93,3 ko	275,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0.2-15	93,0 ko	275,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.0.2-15	106,1 ko	187,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0.2-15	73,6 ko	202,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.0.2-15	91,8 ko	210,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.0.2-15	84,4 ko	1 044,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.0.2-15	82,1 ko	206,0 ko	[liste des fichiers]