Paquet : dialign-tx (1.0.2-14 et autres)

[ Paquet source : dialign-t  ]

alignement séquentiel multiple basé sur les segments

DIALIGN-TX est un outil en ligne de commandes pour réaliser un alignement multiple de séquences de protéines ou d'ADN. C'est une ré-implémentation complète de l'approche basée sur les segments incluant plusieurs nouvelles améliorations et heuristiques qui améliore significativement la qualité des alignements en sortie comparée à DIALIGN 2.2 et DIALIGN-T. Pour les alignements par paires, DIALIGN-TX utilise un algorithme de « fragment- chaining » qui favorise les chaînes d'alignements locaux de faible score plutôt que les fragments isolés de score élevé. Pour l'alignement multiple, DIALIGN-TX utilise une procédure gloutonne améliorée qui est moins sensible aux fausses similitudes locales des séquences.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::comparing, works-with-format::TODO, Format pris en charge: Texte simple, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-14)

  alignement de plusieurs séquences par segments – fichiers de données

• dep: libc6 (>= 2.33) [non amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64]

• enh: t-coffee

  alignement multiple de séquences

Télécharger dialign-tx

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.0.2-14+b1	84,6 ko	218,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0.2-14	85,7 ko	192,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.0.2-14	67,9 ko	184,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.0.2-14	63,2 ko	136,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.0.2-14	75,8 ko	204,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0.2-14	99,4 ko	248,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1.0.2-14	89,4 ko	215,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0.2-14	92,1 ko	213,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0.2-14	71,2 ko	200,0 ko	[liste des fichiers]