Paket: dialign-tx (1.0.2-15 ve diğerleri)

[ Kaynak: dialign-t  ]

Segment-based multiple sequence alignment

DIALIGN-TX is a command line tool to perform multiple alignment of protein or DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach including several new improvements and heuristics that significantly enhance the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2 and DIALIGN-T. For pairwise alignment, DIALIGN-TX uses a fragment-chaining algorithm that favours chains of low-scoring local alignments over isolated high-scoring fragments. For multiple alignment, DIALIGN-TX uses an improved greedy procedure that is less sensitive to spurious local sequence similarities.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c, interface::commandline, Rol: Program, Kapsam: Yardımcı Araç, Amaç: use::comparing, works-with-format::TODO, Desteklenen Biçimler: Düz Metin, Şununla çalışır: Ek etiket gerektiriyor

dialign-tx ile İlgili Diğer Paketler

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-15)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

dialign-tx indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1.0.2-15	104,2 kB	275,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1.0.2-15	85,5 kB	223,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1.0.2-15+b1	92,6 kB	212,0 kB	[dosya listesi]
armel	1.0.2-15	75,1 kB	198,0 kB	[dosya listesi]
armhf	1.0.2-15	66,8 kB	142,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	1.0.2-15	95,7 kB	211,0 kB	[dosya listesi]
i386	1.0.2-15	79,5 kB	210,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	1.0.2-15	151,4 kB	447,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	1.0.2-15	66,0 kB	194,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1.0.2-15	99,9 kB	278,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	1.0.2-15	93,3 kB	275,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1.0.2-15	93,0 kB	275,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1.0.2-15	106,1 kB	187,0 kB	[dosya listesi]
s390x	1.0.2-15	73,6 kB	202,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	1.0.2-15	91,8 kB	210,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	1.0.2-15	84,4 kB	1.044,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	1.0.2-15	82,1 kB	206,0 kB	[dosya listesi]