パッケージ: dialign-tx (1.0.2-15 など)

[ ソース: dialign-t  ]

セグメントベースの多重配列アライメント

DIALIGN-TX はタンパク質または DNA 配列のマルチプルアライメントを実行するた めのコマンドラインツールです。セグメントベースのアプローチの完全な再実装で あり、DIALIGN 2.2 や DIALIGN-T と比較して出力アライメントの品質を有意に向上 するいくつかの新たな改良や発見的手法を含んでいます。ペアワイズアライメント において、DIALIGN-TX は、低スコアの局所アライメントの連鎖を孤立した高スコア の断片より好む、断片連鎖アルゴリズムを使用します。マルチプルアライメントで は、偽の局所的な配列類似性に対する感度を落とすように改良された貪欲法を使用 します。

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::TODO, サポート形式: プレーンテキスト, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の dialign-tx 関連パッケージ

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-15)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

dialign-tx のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.0.2-15	104.2 kB	275.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.0.2-15	85.5 kB	223.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.0.2-15+b1	92.6 kB	212.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.0.2-15	75.1 kB	198.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.0.2-15	66.8 kB	142.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.0.2-15	95.7 kB	211.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.0.2-15	79.5 kB	210.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.0.2-15	151.4 kB	447.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.0.2-15	66.0 kB	194.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.0.2-15	99.9 kB	278.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.0.2-15	93.3 kB	275.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.0.2-15	93.0 kB	275.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.0.2-15	106.1 kB	187.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.0.2-15	73.6 kB	202.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.0.2-15	91.8 kB	210.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.0.2-15	84.4 kB	1,044.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.0.2-15	82.1 kB	206.0 kB	[ファイル一覧]